یک دایناسورشناس پس از مرگ همسرش، ناگهان شبی در میانه یک اقیانوس بزرگ بیدار می شود و وقتی خودش را به یک جزیره می رساند متوجه می شود در دنیایی پر از تکنولوژی های عجیب ، دایناسورها و قبایل در حال جنگ گرفتار شده است و ...

پس از نبرد با دکتر انیمو در یک نیروگاه، بن متوجه می‌شود که اتفاق عجیبی برای امنی‌تریکس در حال رخ دادن است اما به کسی چیزی نمی‌گوید. تتراکس از راه می‌رسد و به آن‌ها می‌گوید که امنی‌تریکس سیگنال خودتخریبی ارسال می‌کند. تتراکس و بن می‌روند تا سازنده امنی‌تریکس را پیدا کنند تا قبل از اینکه خودش و جهان را نابود کند، آن را تعمیر کند. گوئن نیز مخفیانه همراه آن‌ها می‌شود تا به پسرعمویش کمک کند.